Nat Genet： 人类癌症中病原体分布

德国肝恶性肿瘤学术研究中心 Peter Lichter 团队最新学术研究探索了人类肝恶性肿瘤中大肠杆菌的分布。月内《自然—生物化学》在线刊载了这一成果。

作为泛恶性肿瘤均基因分组分析联盟的一部分，该图表库整理了 38 个类型的 2658 例肝恶性肿瘤样本的均基因分组和一部分RNA均基因分组测序图表，学术研究管理人员利用共识的方法，定位了 3 个独立国家图表库用以系统地学术研究潜在的大肠杆菌病原体。在 382 个基因分组和 68 个RNA分组图表集中都检测到了大肠杆菌存在。学术研究见到，已知的与关的的大肠杆菌，如贝克尔—拉尔大肠杆菌（EBV）、乙型肝炎大肠杆菌（HBV）和人瘤大肠杆菌（HPV）的检出率都极更高。

这项学术研究揭示了尾端恶性肿瘤中 HPV 和驱动基因性状的显着实体以及 HPV 与 APOBEC 性状特征的关的性，这说明抗大肠杆菌防御能力下降是宫颈恶性肿瘤、肝恶性肿瘤和尾端恶性肿瘤的诱因。对于 HBV、HPV16、HPV18 和腺体关的大肠杆菌 2，大肠杆菌定位与基因分组拷贝数的局部叠加有关。在 TERT 特异性三处的定位与端粒酶的更高表述有关，从而相对来说抑制了该的发育步骤。内源性逆RNA大肠杆菌的更高表述与肾恶性肿瘤患者较差的生存期有关。

原始出三处：

Zapatka， M.， Borozan， I.， Brewer， D.S. et al. The landscape of viral associations in human cancers. Nat Genet (2020). https：//doi.org/10.1038/s41588-019-0558-9.